Star Wars zoals je het nooit eerder zag, in de eerste lange animatiefilm van Lucasfilm Animation.
Terwijl het heelal geteisterd wordt door de Clone Wars, trachten de Jedi-ridders de orde te handhaven en de vrede te herstellen. Steeds meer stelsels vallen ten prooi aan de duistere kant en de Galactische Republiek dreigt te bezwijken onder de druk van de Separartisten en hun onuitroeibare droïdeleger..
Anakin Skywalker en zijn Padawan-leerling Ahsoka Tano zijn op een missie die verstrekkende gevolgen moet hebben: de confrontatie met Jabba de Hutt. Maar Graaf Dooku en zijn sinistere medewerkers, waaronder de snode Asajj Ventress, doen alles om ervoor te zorgen dat Anakin en Ahsoka in hun opdracht zullen falen.